- Oggetto:
- Oggetto:
Tecniche di laboratorio integrate - C.I.
- Oggetto:
INTEGRATED LABORATORY TECHNIQUES
- Oggetto:
Anno accademico 2018/2019
- Codice dell'attività didattica
- AGR0134
- Docenti
- Prof. Rosemarie TEDESCHI (Affidamento interno)
Prof. Monica MEZZALAMA - Corso di studi
- [001717-101] SCIENZE E TECNOLOGIE AGRARIE - curr. Agrobiotecnologie
- Anno
- 3° anno
- Tipologia
- B - Caratterizzante
- Crediti/Valenza
- 10
- SSD dell'attività didattica
- AGR/11 - entomologia generale e applicata
AGR/12 - patologia vegetale - Modalità di erogazione
- Convenzionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Orale
- Prerequisiti
- Nessuno / None
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Area di apprendimento: Area della difesa.
L'insegnamento ha come obiettivo principale quello di fornire allo studente le basi teoriche e pratiche di alcune tra le principali tecniche molecolari per la diagnosi in campo agrario e di fornire una solida preparazione di base indispensabile per proseguire gli studi universitari.
To acquire the theoretical and practical basis of some of the most used molecular techniques for the diagnosis in agriculture. To have a solid grounding necessary to continue the University studies. The course is included in the learning area of plant protection.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Conoscenza e capacità di comprensione
Alla fine dell'insegnamento lo studente avrà acquisito conoscenze teoriche e pratiche sulle principali tecniche di biologia molecolare applicate al campo agrario, e in particolare in campo fitopatologico ed entomologico.
Capacità di applicare conoscenza e comprensione
Alla fine dell'insegnamento lo studente sarà in grado di ottimizzare e applicare diverse tecniche molecolari a campioni di piante e di insetti e di scegliere quella più adeguata a seconda dell'obiettivo che si vuole raggiungere.
Abilità comunicative
Alla fine dell'insegnamento lo studente sarà in grado di utilizzare un appropriato ed aggiornato vocabolario tecnico relativo alle analisi molecolari.
Knowledge and understanding
At the end of the course, students will have acquired theoretical and practical knowledge on the main techniques of molecular biology applied to agriculture, and in particular to plant pathogen diagnostics for fungal, bacterial phytoplasma and viral diseases and to entomology.
Applying knowledge and understanding
At the end of this course the student will be able to optimize and apply the different molecular techniques to plant and entomological samples and will be able to select the most proper technique depending on the aim of the research
Communication skills
At the end of the course, students will acquire specific and updated technical vocabulary related to plant pathogen diagnostics, applied to fungi, bacteria, phytoplasmas and viruses and diagnostics on insect.
- Oggetto:
Modalità di insegnamento
Il corso consiste di 100 ore di lezione di cui circa 20 dedicate ad attività di laboratorio. Per le lezioni frontali il docente si avvale di presentazioni e slide che sono a disposizione degli studenti.
The course consists of 100 hours about 20 of which devoted to laboratory work. For lectures the teacher makes use of presentations and slides that are available to students.
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
Durante il corso, al termine della trattazione di ogni argomento sarà organizzata una discussione comune sul tema. Le esercitazioni pratiche rappresenteranno un'ulteriore occasione di verifica dell'apprendimento.
L'esame finale è un colloquio orale che prevederà la verifica delle conoscenze acquisite, della capacità di ragionamento e di collegamento fra gli argomenti trattati.
During classes, at the end of the presentation of each topic, a discussion section will be organized. Practicals will be a further occasion to evaluate the level of learning.
The final exam is an oral exam aimed at evaluating the acquired knowledge, the reasoning skills and the ability to discuss and connect the subjects of the course.
- Oggetto:
Programma
- Estrazione di acidi nucleici
- PCR convenzionale e sue modificazioni: multiplex-PCR, nested-PCR, PCR + ibridazione molecolare, ELISA-PCR, etc.. - Real time PCR e Real time RT-PCR per la quantificazione di DNA ed RNA target, LAMP PCR
- Marcatori molecolari: analisi di sequenze mitocondriali e ribosomali, Amplified Fragment Length Polymorphism PCR (AFLP) e Random Amplified Polymorphic DNA PCR (RAPD PCR) per l'analisi di variabilità genetica.
- Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) per lo studio delle comunità microbiche.
- Restriction Fragment lenght polymorphism (RFLP) e RFLP virtuale.
- Ibridazione molecolare su supporto solido, Southern blot, ibridazione in situ
- DNA barcoding
- Applicazioni nanotecnologiche: nanosensori e lab on a chip
- Diagnostica molecolare applicata a funghi, batteri e virus
- Cenni di bioinformatica (blast, allineamento di sequenze, costruzione di alberi filogenetici, metodi di annotazione, analisi di proteine)
- Sequenziamento di genomi
Il corso prevede lezioni teoriche ed esercitazioni pratiche in laboratorio.
- Nucleic acids extraction
- Conventional PCR and modifications: multiplex-PCR, nested-PCR, PCR + molecular hybridisation, ELISA-PCR, etc. - Real Time PCR and Real time RT-PCR for the quantification of target DNA and RNA, LAMP PCR
- Molecular markers: analyses of mitochondrial and ribosomal sequences, Amplified Fragment Lenght Polymorphism PCR AFLP) and Random Amplified Polymorphic DNA PCR (RAPD PCR) for the analysis of genetic variability,
- Molecular hybridisation on a solid carrier, Southern blot, in situ hybridisation,
- DNA barcoding
- Nanotechnological applications: nanosensors and lab on a chip
- Molecular diagnostics applied to fungi, bacteria and viruses
- Bioinformatics (blast, sequence alignment, dendrograms, gene annotation, protein analysis)
- Genome sequencing, transcriptomics (RNA seq)
The course provides for teoretical lessons and practical exercises in the laboratory
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
Materiale didattico inerente gli argomenti trattati a lezione e durante le esercitazioni pratiche sarà disponibile sul portale Campusnet del DISAFA
Educational material concerning the topics of the lessons and the practical exercises will be available on the Campusnet platform
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Note
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Moduli didattici
- Oggetto:
