- Oggetto:
- Oggetto:
Tecniche di diagnosi e analisi molecolari 2 (Anno Accademico 2014/2015)
- Oggetto:
DIAGNOSTICS AND MOLECULAR ANALYSIS TECHNIQUES 2
- Oggetto:
Anno accademico 2014/2015
- Codice dell'attività didattica
- AGR0134
- Docente
- Davide Carmelo SPADARO (Affidamento interno)
- Insegnamento integrato
- Crediti/Valenza
- 4
- SSD dell'attività didattica
- AGR/12 - patologia vegetale
- Modalità di erogazione
- Tradizionale
- Lingua di insegnamento
- Italiano
- Modalità di frequenza
- Facoltativa
- Tipologia d'esame
- Orale
- Prerequisiti
- Nessuno / None
- Oggetto:
Sommario insegnamento
- Oggetto:
Obiettivi formativi
Acquisire le basi teoriche e pratiche di alcune tra le principali tecniche molecolari per la diagnosi in campo agrario. Possedere una solida preparazione di base indispensabile per proseguire gli studi universitari.
To acquire the theoretical and practical basis of some of the most used molecular techniques for the diagnosis in agriculture. To have a solid background necessary to continue the University studies.
- Oggetto:
Risultati dell'apprendimento attesi
Il corso si propone di fornire conoscenze teoriche e pratiche sulle principali tecniche di biologia molecolare applicate al campo agrario.
The course intends to provide theoretical and practical knowlege on the principal molecular biology techniques applied in agriculture.
- Oggetto:
Modalità di verifica dell'apprendimento
Durante il corso, al termine della trattazione di ogni argomento sarà organizzata una discussione comune sul tema. Le esercitazioni pratiche rappresenteranno un'ulteriore occasione di verifica dell'apprendimento.
During classes, at the end of the presentation of each topic, a discussion section will be organized. Practicals will be a further occasion to evaluate the level of learning.
Esame orale
- Oggetto:
Programma
L’area tematica di riferimento è l’Area della difesa, individuata dagli insegnamenti necessari per acquisire conoscenze nel settore dell'entomologia e della patologia vegetale.
Caratteristiche principali di funghi, batteri e virus fitopatogeni
Diagnostica fitopatologica
Osservazione dei sintomi
Isolamento di funghi
Identificazione al microscopio di funghi fitopatogeni
Tecniche immunologiche (ELISA, lateral flow)
Tecniche basate su proteine (isoenzimi, SDS-PAGE, PAGE nativa, Western blot, 2-D elettroforesi)
Tecniche basate sul DNA (cariotipo elettroforetico, RFLP, ibridazione di sonde, Southern blot, PCR, geni ribosomali, ITS, IGS, RAPD, AFLP, trasposoni, ISSR)
Estrazione di DNA da funghi
PCR classica
Elettroforesi su gel di agarosio
Estrazione di RNA
Retrotrascrizione di RNA a cDNA
Real time PCR
Cenni di bioinformatica (blast, allineamento di sequenze, costruzione di alberi filogenetici, metodi di annotazione, analisi di proteine)
Clonaggio di geni, Primer degenerati, gene walking, sequenza genomica e di cDNA, presenza di introni, sequenza proteica, espressione di geni in E.coli e in Pichia pastoris
Sequenziamento di genomi, analisi trascrittomica (microarray e RNA seq)
Applicazioni nanotecnologiche: nanosensori e lab on a chip
Main features of phytopathogenic fungi, bacteria and viruses
Phytopathological diagnostics
Symptom observation
Fungal isolation
Microscope identification of phytopathogenic fungi
Immunological techniques (ELISA, lateral flow)
Protein techniques (isoenzymes, SDS-PAGE, native PAGE, Western blot, 2-D electrophoresis)
DNA techniques (caryotyping, RFLP, probe hybridization, Southern blot, PCR, ribosomal genes, ITS, IGS, RAPD, AFLP, transposons, ISSR)
DNA extraction from fungi
PCR and electrophoresis on agarose gel
RNA extraction, retrotranscription
Real time PCR
Bioinformatics (blast, sequence alignment, dendrograms, gene annotation, protein analysis)
Gene cloning, degenerate primers, gene walking, genomic and cDNA sequence, intron presence, protein sequence, expression in Escherichia coli and in Pichia pastoris
Genome sequencing, transcriptomics (microarray and RNA seq)
Nanotechnological applications: nanosensors and lab on a chip
Caratteristiche principali di funghi, batteri e virus fitopatogeni
Diagnostica fitopatologica: tecniche immunologiche, analisi di proteine e di acidi nucleici.
Cenni di bioinformatica
Genomics and transcriptomics
Applicazioni nanotecnologiche
Main features of phytopathogenic fungi, bacteria and viruses
Phytopathological diagnostics: immunological techniques, analysis of proteins and nucleic acids.
Elements of bioinformatics
Genomics and transcriptomics
Nanotechnological applications
Testi consigliati e bibliografia
- Oggetto:
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Note
Il docente fornirà materiale didattico inerente gli argomenti trattati a lezione e durante le esercitazioni pratiche.
The teacher will provide educational material concerning the topics of the lessons and the practical activities.
- Oggetto:
