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Tecniche di diagnosi applicate agli insetti

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Tecniche di diagnosi applicate agli insetti

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Anno accademico 2023/2024

Codice attività didattica
SAF0254A
Docente
Rosemarie Tedeschi (Affidamento interno)
Corso di studio
[001717-101] SCIENZE E TECNOLOGIE AGRARIE - curr. Agrobiotecnologie
Anno
3° anno
Periodo
Primo semestre
Tipologia
C - Affine o integrativo
Crediti/Valenza
4
SSD attività didattica
AGR/11 - entomologia generale e applicata
Erogazione
Convenzionale
Lingua
Italiano
Frequenza
Facoltativa
Tipologia esame
Orale
Tipologia unità didattica
modulo
Insegnamento integrato
Diagnostica molecolare applicata alla difesa delle colture (SAF0254)
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Sommario insegnamento

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Obiettivi formativi


Vedi scheda generale dell'insegnamento


See general teaching sheet

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Risultati dell'apprendimento attesi

Vedi scheda generale dell'insegnamento

See general teaching sheet

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Programma

Generalità e applicazione delle seguenti tecniche in ambito entomologio.

- Estrazione di acidi nucleici

- PCR convenzionale e sue modificazioni: multiplex-PCR, nested-PCR, PCR + ibridazione molecolare, ELISA-PCR, etc.. - Real time PCR e Real time RT-PCR  per la quantificazione di DNA ed RNA target, LAMP PCR

Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) per lo studio delle comunità microbiche.

- Restriction Fragment lenght polymorphism (RFLP) ed RFLP virtuale.

- Ibridazione molecolare su supporto solido, ibridazione in situ

- DNA barcoding

- Cenni di bioinformatica (blast, allineamento di sequenze, disegno di primer)

-Diagnostica applicata alla marcatura degli insetti

Il corso prevede lezioni teoriche ed esercitazioni pratiche in laboratorio.

General concepts and application of the following techniques in entomology:

- Nucleic acids extraction

- Conventional PCR and modifications: multiplex-PCR, nested-PCR, PCR + molecular hybridisation, ELISA-PCR, etc. - Real Time PCR and Real time RT-PCR for the quantification of target DNA and RNA,  LAMP PCR

- Molecular hybridisation on a solid carrier, in situ hybridisation, FISH

- DNA barcoding

- Bioinformatics (blast, sequence alignment, dendrograms, gene annotation, protein analysis)

- Diagnostics applied to insect marking

 

The course provides for teoretical lessons and practical exercises in the laboratory

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Modalità di insegnamento

Le lezioni frontali saranno erogate in presenza. Il corso consiste di 80 ore di lezione di cui circa 15 dedicate ad attività esercitative. Per le lezioni frontali il docente si avvale di presentazioni e slide che sono a disposizione degli studenti sulla piattaforma Moodle.


Lectures will be provided in class. The course consists of 40 hours about 10 of which devoted to laboratory work. For lectures the teacher makes use of presentations and slides that are available to students on the  Moodle platform.

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Modalità di verifica dell'apprendimento

Durante il corso, al termine della trattazione di ogni argomento sarà organizzata una discussione comune sul tema. Le esercitazioni pratiche rappresenteranno un'ulteriore occasione di verifica dell'apprendimento.

La verifica prevede l'accertamento delle conoscenze acquisite, della capacità di ragionamento e di collegamento fra gli argomenti trattati.

L’esame sarà svolto in forma orale, mediante colloquio in presenza. Il voto sarà espresso in trentesimi.



During classes, at the end of the presentation of each topic, a discussion section will be organized. During classes, at the end of the presentation of each topic, a discussion section will be organized.

The final oral examination aims at evaluating the acquired knowledge, the reasoning skills and the ability to discuss and connect the subjects of the course.The modality will be in presence. The grade will be given in thirtieths.

Testi consigliati e bibliografia

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Testi di approfondimento:

Sambrook J., D.W. Russell. 2001. Molecular cloning, a laboratory manual. Cold Spring laboratory press, Cold Spring Harour, New York. Volume 1, Chapter 5. Gel electrophoresis of DNA and Pulsed -; field Agarose gel electrophoresis.  

Sambrook J., D.W. Russell. 2001. Molecular cloning, a laboratory manual. Cold Spring laboratory press, Cold Spring Harour, New York. Volume 2, Chapter 8. In Vitro amplification of DNA by the Polymerase Chain Reaction.

Reference textbooks:

Educational material concerning the topics of the lessons and the practical exercises will be available on Moodle and Campusnet platforms.

Follow up textbooks:

Sambrook J., D.W. Russell. 2001. Molecular cloning, a laboratory manual. Cold Spring laboratory press, Cold Spring Harour, New York. Volume 1, Chapter 5. Gel electrophoresis of DNA and Pulsed -; field Agarose gel electrophoresis.  

Sambrook J., D.W. Russell. 2001. Molecular cloning, a laboratory manual. Cold Spring laboratory press, Cold Spring Harour, New York. Volume 2, Chapter 8. In Vitro amplification of DNA by the Polymerase Chain Reaction.



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Note

Le modalità di svolgimento dell'attività didattica e della valutazione finale potranno subire variazioni in base alle limitazioni imposte dalla crisi sanitaria.

The modalities of lessons and final examination could be subjected to variations depending on the applied measures related to Covid-19 emergency. 

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Ultimo aggiornamento: 27/09/2023 17:09
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